Austrougarski car Franjo Josip I. s osobitom je pozornošću pratio projektiranje mornaričke crkve u Puli. Bio je nazočan i pri postavljanju kamena temeljca 1891. godine, na Stoji, u pulskoj četvrti San Polikarpo.

Svečana inauguracija Gospe od Mora obavljena je 1898. godine. Projektom je obuhvaćen i okoliš sa skalinadom prema moru. Danas ju posebnom čini vanjski izgled s uzdužnim redovima od bijelog brijunskog kamena i rumenog mramora iz Oprtlja i Brtonigle. Njezini mozaici podsjećaju na porečku baziliku Eufrazijanu i baziliku svetoga Marka u Veneciji. Pred portalom Gospe od mora pozornost privlače stupovi svezani u mornarski, Samsonov uzao.