Rakotule se kao župa spominju od 1580. te iz tog vremena najvjerojatnije potječe i crkva. Bilo je to razdoblje čestih epidemija kuge i kolere u Istri, pa ne čudi da su Rakotuljani upravo Svetog Roka, zaštitnika od tih bolesti uzeli i za zaštitnika svoje župe. Od tada do danas je crkva više puta proširivana i nadograđivana, a novo pročelje izrađeno od domaćeg kamena iz Močitada potiče iz 1934. U zid stare sakristije ugrađena je kamena niša ukrašena reljefnim prikazima s natpisom iz 1560. što daje naslutiti da je crkva još starija. To potvrđuje i još uvijek vidljiv luk romaničke apside. Ta je prvobitna crkva bila oslikana freskama, čiji je jedan fragment otkriven prilikom radova u unutrašnjosti crkve 1958 godine, te je zajedno sa slojem žbuke prebačen na platno i učvršćen. Danas se čuva u Poreču, u biskupijskom muzeju. Uz crkvu je 1850. podignut 22 metra visok zvonik.